La fonctionnalité Messagerie sécurisée d'Owl comprend des notifications par e-mail lorsque de nouveaux messages ont été envoyés ou reçus. Il existe quatre types de notifications relatives à la messagerie sécurisée :
- Messages reçus pour une nouvelle conversation - Une notification par e-mail est envoyée au(x) destinataire(s) des messages d'une nouvelle conversation.
- Nouveaux messages reçus - Owl enverra une notification par e-mail concernant les nouveaux messages reçus après une heure d'inactivité de l'utilisateur. Cette notification est limitée dans le temps en fonction de l'activité de l'utilisateur, ce qui nous permet de minimiser le nombre d'e-mails envoyés aux utilisateurs participant activement aux conversations.
- Participant ajouté - Envoyé aux membres d'une discussion de groupe lorsqu'un nouveau participant a été ajouté à la conversation
- E-mail au nouveau participant - Cette notification est envoyée aux nouveaux participants d'une conversation de groupe déjà en cours pour leur faire savoir qu'ils ont été ajoutés au groupe.
Les notifications par e-mail garantissent que les utilisateurs sont informés des nouveaux messages et conversations auxquels ils participent afin qu'ils ne manquent rien d'important. 
Depuis Owl, vous verrez également des notifications pour les messages. Lorsque vous recevez de nouveaux messages, l'icône en forme de cloche en haut de votre compte est mise en surbrillance avec un indicateur numérique rouge pour vous indiquer le nombre de nouveaux messages non lus que vous avez. Auparavant, lorsque vous cliquiez sur cette icône, vous étiez redirigé vers la section Messagerie d'Owl. Désormais, lorsque vous cliquez sur cette icône, un panneau s'ouvre vous montrant les conversations qui ont reçu de nouveaux messages : 
Toutes les conversations actives apparaissent sous l'en-tête Conversations sécurisées. Toutes les conversations archivées s'affichent dans la section Conversations archivées. Vous pouvez cliquer sur la flèche à côté de chaque section pour la développer et voir tous les messages qu'elle contient. Par défaut, l'en-tête Conversations sécurisées est toujours ouvert pour vous montrer les messages actuels et l'en-tête Conversations archivées est toujours fermé par défaut.
Le panneau d'alerte restera ouvert et persistera dans toutes les zones d'Owl lorsque vous naviguez sur le site, jusqu'à ce que vous cliquiez pour le fermer.
Il existe également un indicateur numérique qui apparaît dans l'onglet Messagerie lorsque vous avez des messages non lus : 
Lorsque vous cliquez sur la section Messagerie , vous verrez des indicateurs numériques sur toutes les conversations contenant des messages non lus, et vous verrez désormais également un indicateur numérique en haut de la section Archive. Ce nouvel indicateur garantit que les cliniques ne manquent aucune réponse des clients qui ont envoyé des messages dans les conversations que vous avez déjà archivées. 
Cliquez simplement sur l’en-tête Conversations archivées pour ouvrir cette section et afficher tous les messages non lus.
Vous pouvez archiver une conversation à tout moment, mais n'oubliez pas que cela archivera uniquement la conversation que vous avez vue. Si un client n'a pas encore archivé une conversation, il peut toujours la considérer comme active et vous envoyer des messages dans cette conversation. Lorsque cela se produit, vous verrez l'indicateur de message numérique à côté de tous les messages que vous avez déjà archivés.